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肠企这两年|中科新生命:靶向肠道代谢物,深挖多组学数据

■ 肠企简介

中科生命(APTBIO)自 2004 年成立以来,已建立科技服务(蛋白/修饰/代谢研究)、生物医药及临床检测三大事业部。APTBIO 前身为中科院上海生命科学研究院蛋白质组研究分析中心(SIBS),是早批参与国际 HLPP(肝脏)、HPPP(血浆)项目的平台之一,已获得 CMA 计量认证、邓白氏认证及 ISO9001 质量认证。伴随质谱技术发展以及临床检验和精准医疗的需求,作为国内质谱技术先行者之一的上海中科新生命,积极布局临床质谱项目,并且结合自身超过 17 年的质谱项目服务经验,持续推动临床质谱研发及转化应用。

■ 这两年|8大事件

① 2019 年,发布中科生信云平台―APT-BioCloud,实现客户自主在线进行组学数据的生信分析。

② 2019 年,荣获 2019 年度“上海市科技小巨人企业”立项。

③ 2020 年,完成约两亿元人民币 A 轮融资,将用于质谱平台产能中心及超算中心建设、精准医疗产品研发及国内外市场拓展。

④ 2020 年,特聘复旦大学丁琛教授、美国普渡大学陶纬国教授为公司技术专家顾问。

⑤ 2020 年,与全球闻名的仪器厂商 ThermoFisher Scientific 及 SCIEX 在多组学及精准医疗领域,建立战略合作伙伴关系。

⑥ 2020 年,成功建立 5000m2 义乌产能中心,并收购泰州临检中心。

⑦ 2020 年,合作客户在 Circulation research 等高水平期刊上发表肠道微生物相关论文 10 余篇,总计影响因子超过 50 分。

⑧ 2021 年,成立中科新生命“创新研究院和院士专家工作站”。

■ 这两年|6大创新

① 2019 年,针对肠道菌群及代谢物的生物标志物的挖掘,自主研发了集成机器学习算法。

② 2020 年,升级推出非靶代谢 plus 产品,大幅提升广谱代谢组学鉴定能力。

③ 2020 年,针对功能微生物组,研发了宏蛋白质组检测分析产品。

④ 2020 年,研发了色氨酸代谢通路检测 KIT,贯通肠道菌群与药靶研究;针对肠道菌群与心血管疾病,研发了 TMAO 靶向代谢 KIT。

⑤ 2020 年,推出包括 16S rDNA 扩增子测序、宏基因组、宏蛋白质、宏代谢组在内的肠道微生物技术全家桶服务,可满足肠道微生物多元化研究需求。

⑥ 2020 年,推出肠-靶轴多组学联合分析方案,提升肠道菌群研究深度。

■ 肠道大会重磅亮相

① G350 高通量靶向肠道代谢组:一次检测包括氨基酸、脂质、胆汁酸在内的 9 大类、350 种肠道菌群相关代谢物。

② 中医药药理研究肠-靶轴多组学解决方案:兼顾中医理论与创新研究,三大专属分析助力中医药药理功能表征。

③ 肠道健康产业的产品功能表征服务:功能食品、乳制品、益生元等对肠道微生物及机体关键指标影响的动态检测。

■ 专访

问:中科新生命针对肠道微生物研究,率先在今年 3 月发布了新产品――G350 高通量靶向肠道代谢组。相比普通的靶向代谢组,此项技术服务有哪些特色和优势呢?能否为我们展示几项利用此技术的最新研究成果吗?

答:G350 和普通的靶向代谢组相比,有两大优势:

一是通量高,G350 一次可以高通量检测 350 种代谢物,而常规的靶向代谢组一次只能检测 1-30 种代谢物。这使得检测相同数量的肠道微生物代谢,时间和成本上都可以节省 10 倍之多;

二是指向性强,这 350 种代谢物与肠道微生物密切相关,研究者不用再纠结到底是检测短链脂肪酸、氨基酸还是胆汁酸。正是因为通量和指向性上的优势,使得高效探索肠道微生态中的更多未知成为可能。

目前,利用该技术实施的研究项目大多还处于未发表阶段,因此我们主要展示一下在开发过程中,实际用人血和粪便样本的代谢物检出情况。

问:如今围绕肠道健康和肠道微生态的研究如火如荼,但大多采用基因组学和代谢组学的研究策略。中科新生命作为国内较早提供专业蛋白组技术服务的公司之一,认为围绕肠道的其它组学技术的研究趋势和应用潜力如何,是否有相应的发展战略布局呢?

答:目前,在肠道微生态研究中,基因组学和代谢组学是应用十分广泛的技术手段。与此同时,我们也发现其它组学技术同样具有巨大的应用潜力。

例如,蛋白质组学,既可以应描述宏蛋白质组的变化特征,表征菌群的实际功能差异,也可以应用于靶器官的蛋白质组比对分析,从而系统描述肠-靶轴的调控机制;修饰蛋白质组学,对于脑部等靶器官的调控机制描述更为精准,具有重要的应用价值。

以上提到的技术,都已经是我们成熟的产品。我们也在热切关注其它前沿技术,例如单细胞转录组、单细胞蛋白质组等,相信这些技术在肠道免疫调控、肠道肿瘤等方向的研究中将会发挥巨大作用,目前正在积极布局,敬请各位期待。

问:除了科研服务,中科新生命还布局了产业链的生物医药和临床检测板块。贵公司认为当前肠道产业相关的食品医药(如微生态制剂和生物活体药)的研发、检测及临床应用有哪些机遇和挑战呢?对此公司将如何应对呢?近期/未来会有什么动作吗?

答:我们认为,肠道产业目前的主要挑战有两个:

(1)如何在成千上万的肠道微生物研究中找到真正具有应用潜力的菌种、诊断标志物或干预方式;

(2)如何对肠道产业相关产品进行科学、有效的功能评价。

我们在布局肠道科研领域的同时,也非常注重组学大数据的深度挖掘,肠-靶轴多组学数据的积累以及生物信息学工具的开发,这些将是未来我们进军肠道临检/医药产业的技术优势。